28S riboszómális RNS - 28S ribosomal RNA
A 28S riboszómális RNS az eukarióta citoplazmatikus riboszómák nagy alegységének (LSU) strukturális riboszómális RNS -e (rRNS) , és így az összes eukarióta sejt egyik alapvető összetevője. Mérete növényekben 25S, emlősökben 28S, innen ered a 25S – 28S rRNS álneve .
Kombinálva 5,8S rRNS -sel az 5 'oldalon, ez a prokarióta 23S és a mitokondriális 16S riboszómális RNS eukarióta nukleáris homológja .
Filogenézisben használható
A 28S rRNS -t kódoló géneket 28S rDNS -nek nevezik. Az ezekből a génekből származó szekvenciák összehasonlítását néha molekuláris elemzésben használják filogenetikus fák felépítésére , például protisták , gombák , rovarok , tardigrádák és gerincesek esetében .
Szerkezet
A 28S rRNS tipikusan 4000–5000 nt hosszú.
Néhány eukarióta két részre bontja a 28S rRNS -t, mielőtt mindkettőt a riboszómába gyűjti, ezt a jelenséget "rejtett törésnek" nevezik.
Adatbázisok
Számos adatbázis összehasonlító célokra biztosítja az LSU rRNS szekvenciák igazítását és megjegyzéseit :
- RDP, a Ribosomal Database Project;
- SILVA, riboszómális RNS gén adatbázis projekt.