Exoribonukleáz - Exoribonuclease
Egy exoribonuclease egy exonukleáz ribonukleáz , amelyek enzimeket, amelyek degradálják RNS eltávolításával terminális nukleotid akár az 5' végén , vagy a 3' végén az RNS-molekula. Azokat az enzimeket, amelyek eltávolítják az 5'- vég nukleotidjait, 5'-3 'exoribonukleázoknak , az enzimeket, amelyek eltávolítják a nukleotidokat a 3'-végről, 3'-5' exoribonukleázoknak .
Az exoribonukleázok vagy vizet használhatnak a nukleotid-nukleotid kötés (amelyet hidrolitikus aktivitásnak neveznek), vagy szervetlen foszfát (amelyet foszforolitikus aktivitásnak neveznek) hasítására . A hidrolitikus exoribonukleázokat az EK 3.1., A foszforolitikus exoribonukleázokat pedig a 2.7.7. Mivel a foszforolitikus enzimek szervetlen foszfátot használnak a kötések hasításához, nukleotid-difoszfátokat , míg a hidrolitikus enzimek (amelyek vizet használnak) nukleotid-monoszfoszfátokat szabadítanak fel .
Az exoribonukleázok az élet minden országában, a baktériumokban , az archeákban és az eukariótákban léteznek . Az exoribonukleázok számos különböző RNS-faj lebontásában vesznek részt, ideértve a messenger RNS-t , a transzfer RNS-t , a riboszomális RNS-t és a miRNS-t . Az exoribonukleázok lehetnek egyedi fehérjék (például RNáz D vagy RNáz PH ), de lehetnek több fehérje komplexei is, például az exoszóma komplex (amelyben a főbb exoribonukleáz családok közül négy képviselteti magát).
Nagyobb családok
| Család | Példa tagok | terjesztés | Katalitikus aktivitás |
|---|---|---|---|
| RNR | RNase R | A legtöbb baktérium, minden eukarióta | 3'-5 'hidrolitikus |
| RNáz II | |||
| Rrp44 | |||
| DEDD | RNase D | Bizonyos baktériumok, az összes eukarióta | 3'-5 'hidrolitikus |
| RNase T | |||
| PM / Scl-100 | |||
| Oligoribonukleáz | |||
| RBN | RNase BN | Bizonyos baktériumok | 3'-5 'hidrolitikus |
| PDX | PNPase | Minden királyság | 3'-5 'foszforolitikus |
| PM / Scl-75 | |||
| RNase PH | |||
| RRP4 | Rrp4 | Minden eukarióta, a legtöbb archeák | 3'-5 'hidrolitikus |
| 5PX | I. exoribonukleáz | Minden eukarióta | 5'-3 'hidrolitikus |
| Exoribonukleáz II |
Lásd még
Hivatkozások
- Zuo Y; Deutscher képviselő. (2001). "Exoribonukleáz szupercsaládok: strukturális elemzés és filogenetikai eloszlás" . Nukleinsavak Res . 29 (5): 1017–26. doi : 10.1093 / nar / 29.5.1017 . PMC 56904 . PMID 11222749 .
Külső linkek
- Exoribonukleázok az Egyesült Államok Országos Orvostudományi Könyvtárának Medical Subject Headings (MeSH)