Humán koronavírus HKU1 -Human coronavirus HKU1

Emberi koronavírus HKU1
Koronavírus-HKU1.png
A HcoV-HKU1 kialakulása.
Vírusok osztályozása e
(rendezetlen): Vírus
Birodalom : Riboviria
Királyság: Orthornavirae
Törzs: Pisuviricota
Osztály: Pisoniviricetes
Rendelés: Nidovirales
Család: Coronaviridae
Nemzetség: Betacoronavírus
Algenus: Embecovírus
Faj:
Emberi koronavírus HKU1

A humán koronavírus HKU1 ( HCoV -HKU1 ) azemberek koronavírus -fajtája. Felső légúti betegséget okoz a közönséges megfázás tüneteivel, de előrehaladhat tüdőgyulladásban és hörghurutban . Először 2004 januárjában fedezték fel egy férfitól Hong Kongban . A későbbi kutatások azt mutatták, hogy globális elterjedésű és korábbi keletkezésű.

A vírus egy burkolt , pozitív értelemben vett , egyszálú RNS-vírus, amely az N-acetil-9-O-acetil-neuraminsav-receptorhoz kötődve jut be gazdasejtjébe . Azt a hemagglutinint észteráz (HE) gén, ami megkülönbözteti tagjaként a nemzetség Betacoronavirus és alnemzetségébe Embecovirus .

Történelem

A HCoV-HKU1-et először 2004 januárjában észlelték egy 71 éves férfiban, akit akut légzési distressz szindróma és radiográfiásan megerősített kétoldalú tüdőgyulladás miatt kórházba szállítottak . A férfi nemrég tért vissza Hongkongba a kínai Shenzhenből .

Virológia

Woo és munkatársai sikertelenül próbálkoztak HCoV-HKU1 izolátum termesztésével, de sikerült megszerezniük a teljes genomi szekvenciát. A filogenetikai elemzés kimutatta, hogy a HKU1 a legközelebb áll az egér hepatitisz vírusához (MHV), és e tekintetben különbözik más ismert humán betakoronavírusoktól , például a HCoV -OC43-tól .

Az RNS-függő RNS-polimeráz (RdRp), a tüske (S) és a nukleokapszid (N) gének elemzésekor inkompatibilis filogenetikai összefüggéseket fedeztek fel. 22 HCoV-HKU1 törzs teljes genomszekvenálása megerősítette, hogy ez a természetes rekombinációnak köszönhető. A HCoV-HKU1 valószínűleg rágcsálókból származik .

A HCoV-HKU1 egyike a hét ismert koronavírusnak, amelyek megfertőzik az embereket. A többi hat:

A HCoV-HKU1 tüske (S) és a HE fehérjék szerkezetét a Cryo-EM feloldotta 2016 - ban, illetve 2020-ban. Az S fehérje ( PDB : 5I08 ) nagy méretéről ismert. A HE fehérje ( PDB : 6Y3Y ) abban különbözik a hagyományos (például az OC43 -ban) fehérjétől , hogy sokkal kisebb a vesztiális lektin doménje. Ezt a domaint a méretváltozások és a glikozilezés védi az immunrendszer felismerésétől.

Járványtan

A 2003-as SARS-időszakban légúti betegségben szenvedő betegek SARS-negatív nasopharyngealis aspirációinak nyomon követett elemzése azonosította a CoV-HKU1 RNS jelenlétét a 35 éves tüdőgyulladásban szenvedő nő mintájában.

A HCoV-HKU1 felfedezéséről szóló első jelentések után a vírust ugyanebben az évben azonosították 10 betegnél Észak-Ausztráliában . Légzőszervi mintákat gyűjtöttek május és augusztus között (Tél Ausztráliában). A nyomozók azt találták, hogy a legtöbb HCoV-HKU1 pozitív minta a gyermekektől származik a későbbi téli hónapokban.

Az első ismert eseteket a nyugati féltekén 2005-ben fedezték fel, miután a Connecticut állambeli New Haven - i Yale-New Haven Kórház klinikai virológusai elemezték az idősebb mintákat, és kíváncsiak voltak arra, hogy a HCoV-HKU1 van-e a területükön. Vizsgálatot végeztek a 7 hetes időszakban (2001. december-2002. február) összegyűjtött példányokon 851 csecsemőn és gyermeken. Kilenc gyermek mintáiban volt humán koronavírus HKU1. Ezeknek a gyermekeknek a minták összegyűjtésekor légúti fertőzéseik voltak (az egyik lánynál olyan súlyos volt, hogy gépi lélegeztetésre volt szükség), míg más okok miatt negatív eredményt mutattak, mint például a humán légzőszervi vírus (RSV), parainfluenza vírusok (1-3. Típus) , influenza A és B vírusok , és adenovírus által közvetlen immunfluoreszcens vizsgálati eljárással , valamint az emberi metapneumovírus és HCoV-NH által reverz transzkripciós polimeráz-láncreakció (RT-PCR). A kutatók arról számoltak be, hogy a New Havenben azonosított törzsek hasonlóak a Hongkongban talált törzsekhez, és világszerte elterjedést javasoltak. Ezeket a New Havenben talált törzseket nem szabad összetéveszteni a HCoV-NH-val (New Haven coronavirus), amely a humán NL63 koronavírus-törzs .

2005 júliusában hat esetet jelentettek Franciaországban. Ezekben az esetekben a francia nyomozók továbbfejlesztett technikákat alkalmaztak a vírus nasopharyngealis aspirátumokból és székletmintákból való kinyerésére.

Lásd még

Hivatkozások

Külső linkek