Humán koronavírus HKU1 -Human coronavirus HKU1
Emberi koronavírus HKU1 | |
---|---|
A HcoV-HKU1 kialakulása. | |
Vírusok osztályozása | |
(rendezetlen): | Vírus |
Birodalom : | Riboviria |
Királyság: | Orthornavirae |
Törzs: | Pisuviricota |
Osztály: | Pisoniviricetes |
Rendelés: | Nidovirales |
Család: | Coronaviridae |
Nemzetség: | Betacoronavírus |
Algenus: | Embecovírus |
Faj: |
Emberi koronavírus HKU1
|
A humán koronavírus HKU1 ( HCoV -HKU1 ) azemberek koronavírus -fajtája. Felső légúti betegséget okoz a közönséges megfázás tüneteivel, de előrehaladhat tüdőgyulladásban és hörghurutban . Először 2004 januárjában fedezték fel egy férfitól Hong Kongban . A későbbi kutatások azt mutatták, hogy globális elterjedésű és korábbi keletkezésű.
A vírus egy burkolt , pozitív értelemben vett , egyszálú RNS-vírus, amely az N-acetil-9-O-acetil-neuraminsav-receptorhoz kötődve jut be gazdasejtjébe . Azt a hemagglutinint észteráz (HE) gén, ami megkülönbözteti tagjaként a nemzetség Betacoronavirus és alnemzetségébe Embecovirus .
Történelem
A HCoV-HKU1-et először 2004 januárjában észlelték egy 71 éves férfiban, akit akut légzési distressz szindróma és radiográfiásan megerősített kétoldalú tüdőgyulladás miatt kórházba szállítottak . A férfi nemrég tért vissza Hongkongba a kínai Shenzhenből .
Virológia
Woo és munkatársai sikertelenül próbálkoztak HCoV-HKU1 izolátum termesztésével, de sikerült megszerezniük a teljes genomi szekvenciát. A filogenetikai elemzés kimutatta, hogy a HKU1 a legközelebb áll az egér hepatitisz vírusához (MHV), és e tekintetben különbözik más ismert humán betakoronavírusoktól , például a HCoV -OC43-tól .
Az RNS-függő RNS-polimeráz (RdRp), a tüske (S) és a nukleokapszid (N) gének elemzésekor inkompatibilis filogenetikai összefüggéseket fedeztek fel. 22 HCoV-HKU1 törzs teljes genomszekvenálása megerősítette, hogy ez a természetes rekombinációnak köszönhető. A HCoV-HKU1 valószínűleg rágcsálókból származik .
A HCoV-HKU1 egyike a hét ismert koronavírusnak, amelyek megfertőzik az embereket. A többi hat:
- Humán koronavírus 229E (HCoV-229E)
- Emberi koronavírus NL63 (HCoV-NL63)
- Emberi koronavírus OC43 (HCoV-OC43)
- Közel-keleti légúti szindrómával kapcsolatos koronavírus (MERS-CoV)
- Súlyos akut légúti szindróma koronavírus (SARS-CoV-1)
- Súlyos akut légúti szindróma koronavírus 2 (SARS-CoV-2)
A HCoV-HKU1 tüske (S) és a HE fehérjék szerkezetét a Cryo-EM feloldotta 2016 - ban, illetve 2020-ban. Az S fehérje ( PDB : 5I08 ) nagy méretéről ismert. A HE fehérje ( PDB : 6Y3Y ) abban különbözik a hagyományos (például az OC43 -ban) fehérjétől , hogy sokkal kisebb a vesztiális lektin doménje. Ezt a domaint a méretváltozások és a glikozilezés védi az immunrendszer felismerésétől.
Járványtan
A 2003-as SARS-időszakban légúti betegségben szenvedő betegek SARS-negatív nasopharyngealis aspirációinak nyomon követett elemzése azonosította a CoV-HKU1 RNS jelenlétét a 35 éves tüdőgyulladásban szenvedő nő mintájában.
A HCoV-HKU1 felfedezéséről szóló első jelentések után a vírust ugyanebben az évben azonosították 10 betegnél Észak-Ausztráliában . Légzőszervi mintákat gyűjtöttek május és augusztus között (Tél Ausztráliában). A nyomozók azt találták, hogy a legtöbb HCoV-HKU1 pozitív minta a gyermekektől származik a későbbi téli hónapokban.
Az első ismert eseteket a nyugati féltekén 2005-ben fedezték fel, miután a Connecticut állambeli New Haven - i Yale-New Haven Kórház klinikai virológusai elemezték az idősebb mintákat, és kíváncsiak voltak arra, hogy a HCoV-HKU1 van-e a területükön. Vizsgálatot végeztek a 7 hetes időszakban (2001. december-2002. február) összegyűjtött példányokon 851 csecsemőn és gyermeken. Kilenc gyermek mintáiban volt humán koronavírus HKU1. Ezeknek a gyermekeknek a minták összegyűjtésekor légúti fertőzéseik voltak (az egyik lánynál olyan súlyos volt, hogy gépi lélegeztetésre volt szükség), míg más okok miatt negatív eredményt mutattak, mint például a humán légzőszervi vírus (RSV), parainfluenza vírusok (1-3. Típus) , influenza A és B vírusok , és adenovírus által közvetlen immunfluoreszcens vizsgálati eljárással , valamint az emberi metapneumovírus és HCoV-NH által reverz transzkripciós polimeráz-láncreakció (RT-PCR). A kutatók arról számoltak be, hogy a New Havenben azonosított törzsek hasonlóak a Hongkongban talált törzsekhez, és világszerte elterjedést javasoltak. Ezeket a New Havenben talált törzseket nem szabad összetéveszteni a HCoV-NH-val (New Haven coronavirus), amely a humán NL63 koronavírus-törzs .
2005 júliusában hat esetet jelentettek Franciaországban. Ezekben az esetekben a francia nyomozók továbbfejlesztett technikákat alkalmaztak a vírus nasopharyngealis aspirátumokból és székletmintákból való kinyerésére.
Lásd még
Hivatkozások
Külső linkek
- A humán koronavírus HKU1 -hez kapcsolódó adatok a Wikispeciesben