Pozitív szálú RNS vírus - Positive-strand RNA virus
Pozitív szálú RNS vírus | |
---|---|
Hepatitis C vírus | |
A vírusok osztályozása | |
Csoport: |
IV. Csoport ( (+) ssRNS )
|
Királyság: Lovag: Osztály | |
Szinonimák | |
|
A pozitív szálú RNS vírusok ( +ssRNS vírusok ) olyan rokon vírusok csoportja , amelyek pozitív értelemben vett , egyszálú ribonukleinsavból álló genomokkal rendelkeznek . A pozitív értelemben vett genom hírvivő RNS-ként (mRNS) működhet, és a gazdasejt riboszómái közvetlenül lefordíthatják vírusfehérjékké . A pozitív szálú RNS-vírusok egy RNS-függő RNS-polimerázt (RdRp) kódolnak, amelyet a genom replikációja során használnak a negatív értelemben vett antigenom szintetizálására, amelyet sablonként használnak fel egy új pozitív érzékű vírusgenom létrehozásához.
A pozitív szálú RNS vírusok a phyla Kitrinoviricota , Lenarviricota és Pisuviricota (különösen a Pisoniviricetes és Stelpavirictes osztályok) között oszlanak meg , amelyek mindegyike az Orthornavirae és a Riboviria birodalomban található . Ezek monofiletikus és leereszkedett egy közös őstől RNS-vírus. A Baltimore osztályozási rendszerben a +ssRNS vírusok a IV.
A pozitív értelemben vett RNS-vírusok közé tartoznak a kórokozók , például a hepacivírus C , a Nyugat-nílusi vírus , a dengue-vírus és a MERS , a SARS és a SARS-CoV-2 koronavírusok , valamint a kevésbé klinikailag súlyos kórokozók, mint például a koronavírusok és a rhinovírusok , amelyek közönséges megfázás .
Genom
A pozitív szálú RNS-vírus genomjai általában viszonylag kevés gént tartalmaznak, általában három és tíz között, beleértve az RNS-függő RNS-polimerázt. Coronavírusok a legnagyobb ismert RNS-genomja, 27 és 32 kilobázis hosszúságú, és valószínű, rendelkeznek replikációs lektorálás mechanizmusok formájában exoribonuclease belül nem szerkezeti fehérjét nsp14.
Replikáció
A pozitív szálú RNS vírusok genetikai anyaggal rendelkeznek, amely genomként és hírvivő RNS- ként is funkcionálhat ; akkor közvetlenül fordította a protein a gazdasejt által host riboszómák . Az első fehérjéket kell kifejezni a fertőzés után szolgálnak genom replikációs funkciókat; a pozitív szálú vírusgenomot toborozzák az intracelluláris membránokkal összefüggésben kialakult vírusreplikációs komplexekhez. Ezek a komplexek mind vírusos, mind gazdasejt eredetű fehérjéket tartalmaznak, és különféle organellák membránjaihoz kapcsolódhatnak - gyakran a durva endoplazmatikus retikulumhoz , de ideértve a mitokondriumokból , vakuolákból , a Golgi -készülékből , a kloroplasztokból , a peroxiszómákból , a plazmából származó membránokat is. membránok , autofagoszomális membránok és új citoplazmatikus rekeszek.
A pozitív értelemben vett RNS genom replikációja kettős szálú RNS intermediereken keresztül megy végbe , és a replikáció célja ezekben a membrános invaginációkban a dsRNS jelenlétére adott sejtválasz elkerülése lehet. Sok esetben szubgenomiális RNS -ek is keletkeznek a replikáció során. A fertőzés után a gazdasejt transzlációs gépezetének egészét vírusfehérjék előállítására lehet fordítani, mivel a vírusgenom belső riboszóma belépési helyének (IRES) elemei nagyon nagy affinitást mutatnak a riboszómák iránt ; Egyes vírusok, mint például a poliovírus és a rhinovírusok , normál fehérjeszintézis tovább károsodik virális proteázok lebontó szükséges komponensek iniciálására a celluláris mRNS.
Minden pozitív szálú RNS-vírus genom RNS-függő RNS-polimerázt kódol, egy vírusfehérjét, amely RNS-templátból szintetizálja az RNS-t. A replikáció során a +ssRNS vírusok által toborzott gazdasejtfehérjék közé tartoznak az RNS-kötő fehérjék , a chaperone fehérjék , valamint a membrán átalakító és lipid szintézis fehérjék, amelyek együttesen részt vesznek a sejt szekréciós útvonalának kiaknázásában a vírus replikációjához.
Rekombináció
Számos pozitív szálú RNS vírus genetikai rekombináción eshet át, ha legalább két vírusgenom van jelen ugyanazon gazdasejtben. Az emberek +ssRNS vírus kórokozói között gyakori a rekombinációs képesség. Úgy tűnik, hogy az RNS rekombináció fő hajtóerő a genom architektúra és a vírusfejlődés lefolyásának meghatározásában a Picornaviridae családban (pl. Poliovírus). A Retroviridae -k (pl. HIV ) esetében úgy tűnik, hogy a genomkárosodás elkerülhető a reverz transzkripció során szálváltással, amely a rekombináció egy formája. A rekombináció a Coronaviridae családban (pl. SARS ) fordul elő . Az RNS -vírusok rekombinációja úgy tűnik, hogy alkalmazkodik a genomkárosodás kezeléséhez. Ritkán fordulhat elő rekombináció ugyanazon faj +ssRNS vírusai között is, de eltérő vonalúak. A keletkező rekombináns vírusok néha fertőzések kitörését okozhatják az emberekben, mint a SARS és a MERS esetében.
A pozitív szálú RNS vírusok gyakoriak a növényekben. A tombuszvírusokban és a carmovírusokban az RNS -rekombináció gyakran előfordul a replikáció során. Ezen vírusok RNS-függő RNS-polimerázának az RNS-sablonok váltására való képessége az RNS-rekombináció másolatválasztási modelljét sugallja, amely adaptív mechanizmus lehet a vírusgenom károsodásának leküzdésében. A növények más + ssRNS vírusairól is beszámoltak, hogy képesek a rekombinációra, mint például a Brom mozaik bromovírus és a Sindbis vírus .
Osztályozás
Pozitív szálú RNS-vírusok találhatók három fajban : Kitrinoviricota , Lenarviricota és Pisuviricota , amelyek mindegyike az Orthornavirae királysághoz tartozik a Riboviria tartományban . A Baltimore osztályozási rendszerben, amely a vírusokat mRNS -szintézisük alapján csoportosítja, a +ssRNS vírusok a IV.
Kitrinoviricota
Az első + ssRNS törzs a Kitrinoviricota . A törzs tartalmaz, amit már említett, mint a „ alfavírus szupergroup” és „ flavivirus supergroup”, valamint különféle egyéb rövid genom vírusok. A törzs négy osztályát ismerik el: az Alsuviricetes , az alfa -vírus szupercsoport, amely nagyszámú növényi és ízeltlábú vírust tartalmaz; Flasuviricetes , amely flavivírusokat tartalmaz, Magsaviricetes , amely nodavírusokat és szinhalivírusokat tartalmaz ; és Tolucaviricetes , amely elsősorban növényi vírusokat tartalmaz.
Lenarviricota
A Lenarviricota a második + ssRNS törzs. Tartalmazza a Leviviricetes osztályt, amely megfertőzi a prokariótákat , és a levivírusok látszólagos leszármazottait, amelyek megfertőzik az eukariótákat . A törzs négy osztályba sorolható: a Leviviricetes , amely levivírusokat és hozzátartozóikat tartalmazza, az Amabiliviricetes , amely narnavírusokat és azok hozzátartozóit tartalmazza, a Howeltoviricetes , amely mitovírusokat és hozzátartozóikat tartalmazza, valamint a Miaviricetes , amely botourmiavírusokat és rokonaikat tartalmazza. Az RdRp filogenetikai elemzése alapján az összes többi RNS -vírus a Lenarviricota vonatkozásában testvérkládnak tekinthető .
Pisuviricota
A harmadik, + ssRNS vírusokat tartalmazó törzs a Pisuviricota , amelyet informálisan "pikornavírus szupercsoportnak" neveztek. A törzs nagyszámú eukarióta vírust tartalmaz, amelyekről ismert, hogy állatokat, növényeket, gombákat és protistákat fertőznek meg. A törzs három osztályt tartalmaz, amelyek közül kettő csak + ssRNS vírusokat tartalmaz: a Pisoniviricetes , amely nidovírusokat , pikornavírusokat és sobelivírusokat tartalmaz , és a Stelpaviricetes , amely potyvírusokat és asztrovírusokat tartalmaz . A harmadik osztály a Duplopiviricetes , amelynek tagjai kettős szálú RNS vírusok, amelyek a +ssRNS vírusokból származnak.