AAC / AAD vezető - AAC/AAD leader

Feltételezett aminoglikozid riboszkapcsoló / attI hely
Azonosítók
Szimbólum AAC_AAD_leader
Rfam RF02912
Más adatokat
PDB struktúrák PDBe

Az AAC / AAD 5 'vezetője egy vitatott genetikai elem, amelyet konzervált RNS- struktúrának javasoltak, amely a baktériumok aminoglikozidjai antibiotikum-rezisztens gének előtt található, és amely aminoglikozid-specifikus riboszkapcsolóként működik . A feltételezett RNS az aminoglikozid- acetil-transzferáz (AAC) és az aminoglikozid-adenil-transzferáz (AAD) génjei előtt helyezkedik el.

A kezdeti jelentés szerint rövid nyitott leolvasási kerettel (ORF) rendelkezik, amely egy vezető peptidet kódol a rezisztencia gén előtt. Úgy tűnik, hogy az első riboszóma kötődési helyétől a kódoló szekvenciáig terjedő, 75 nukleotid hosszúságú szekvenciának szabályozó szerepe van, és ezt minimális funkcionális RNS-nek tekintették. A javasolt modell szerint az aminoglikozidok kötődnek az AAC / AAD 5 'vezető specifikus régióihoz, és változást idéznek elő az RNS szerkezetében, ezáltal indukálják a downstream gén által kódolt rezisztencia fehérje expresszióját. A kezdeti jelentés eredményei szerint a vezető RNS széles körben eloszlik az antibiotikumokkal szemben rezisztens baktérium kórokozók között.

Egy későbbi levél vitatta ezeket az állításokat. Ez a levél kimondta, hogy a javasolt riboswitch megegyezik az attI helyével, amely az integronok korábban ismert része, és a rekombináció jele , amely gyakori folyamat az integronokban. A levél egyebek mellett azt is megállapította, hogy a feltételezett riboswitchnek nincsenek további konzervált tulajdonságai az attI-nél korábban megállapítottakon túl , hogy a riboswitch / attI olyan génekkel is társul, amelyek rezisztenciát kölcsönöznek az aminoglikozidokkal nem rokon antibiotikumokkal szemben (vagy más nem rokon fehérjéket kódolnak), és a levél azt javasolta, hogy az eredeti tanulmány eredményeit az ORF-et magában foglaló, korábban ismertetett mechanizmus magyarázza. Az eredeti cikk szerzői erre a levélre adtak választ.

Hivatkozások