CLPB - CLPB

CLPB
Azonosítók
Álnevek CLPB , HSP78, SKD3, ANKCLB, MEGCANN, MGCA7, ClpB homológ, mitokondriális AAA ATPáz chaperonin, kazeinolitikus mitokondriális mátrix peptidáz chaperone B alegység
Külső azonosítók OMIM : 616254 MGI : 1100517 HomoloGene : 32067 GeneCard : CLPB
Ortológusok
Faj Emberi Egér
Entrez

81570

20480
Ensembl

ENSG00000162129

ENSMUSG00000001829
UniProt

Q9H078

Q60649
RefSeq (mRNS)

NM_001258392
NM_001258393
NM_001258394
NM_030813

NM_009191
NM_001363991
RefSeq (fehérje)

NP_001245321
NP_001245322
NP_001245323
NP_110440

NP_033217
NP_001350920
Helyszín (UCSC) Kr. 11: 72,29 - 72,43 Mb Kr. 7.: 101.66 - 101.8 Mb
PubMed keresés
Wikidata
View/Edit Human Egér megtekintése/szerkesztése

A kazeinolitikus peptidáz B fehérje homológ ( CLPB ), más néven Skd3, egy mitokondriális AAA ATPáz chaperon , amelyet emberekben a CLPB gén kódol , amely egy adenozin-trifoszfát (ATP) -függő chaperont kódol . Az Skd3 a mitokondriumokban lokalizálódik és széles körben expresszálódik az emberi szövetekben. A felnőtt agyban magas és a granulocitákban alacsony expresszió tapasztalható. Ez egy erős fehérjebontás, amely a mitokondriális intermembrán teret kíséri. Mutációk a cipB gén okozhat autoszomális recesszív anyagcsere-rendellenesség értelmi fogyatékosság / fejlődési késéssel, veleszületett neutropenia , progresszív agyi atrófia, mozgási rendellenesség, szürkehályog , és a 3-methylglutaconic aciduria . A közelmúltban a CLPB heterozigóta, domináns negatív mutációit azonosították súlyos veleszületett neutropenia (SCN) okának .

Szerkezet

Gén

A cipB gén 19 exont és található a kromoszómán sávban 11q13.4.

Fehérje

Az Skd3 öt izoformát tartalmaz az alternatív illesztés miatt. Az 1. izoforma tekinthető „kanonikus” szekvenciának. A fehérje 78,7 kDa méretű és 707 aminosavból áll. Tartalmaz egy N-terminális mitokondriális célzó szekvenciát (1-92 aminosav). A feldolgozás után az érett mitokondriális fehérje elméleti pI értéke 7,53. Az Skd3-at a PARL mitokondriális romboid proteáz tovább dolgozza fel a 127. aminosavnál. Az Skd3-nak van egy specifikus C-terminális D2 doménje, és a fehérjék ezzel a doménnel alkotják a kazeinolitikus peptidáz (Clp) fehérjék alcsaládját, más néven HSP100. A tartomány összetétele humán Skd3 eltér a mikrobiális vagy növényi ortológjaival. Nevezetesen, az ankirin ismétlődések jelenléte helyettesítette a baktériumokban és gombákban található két ATPáz domén közül az elsőt .

Funkció

Az Skd3 a nagy AAA+ szupercsalád HCLR kládjába tartozik . Ennek a családnak az egyesítő jellemzője az ATP hidrolízise az AAA+ doménen keresztül, hogy energiát termeljen a fehérjék kibontásához, szétszereléséhez és széteséséhez . Az Skd3 nem működik együtt a HSP70 -tel , ellentétben a bakteriális ortológjával. Az Skd3 in vitro ATPáz aktivitását megerősítették. Az Skd3 egy erős dezaggregáz in vitro, és a PARL aktiválja, hogy több mint 10-szeresére növelje a bomlási aktivitást. Valójában a PARL -aktivált Skd3 képes szétszedni az alfa -szinuklein fibrillákat in vitro . Annak ellenére, hogy a ClpB bakteriális ortológ hozzájárul a sejtek hőtűréséhez, még nem világos, hogy az Skd3 hasonló szerepet játszik -e a mitokondriumokban. A fehérjével, például a HAX1 -nel való kölcsönhatás arra utal, hogy az emberi Skd3 részt vehet az apoptózisban . Valójában az Skd3 szolubilizálja a HAX1 -et a sejtekben, és a CLPB gén deléciója humán sejtekben bizonyítottan érzékenyíti a sejteket az apoptotikus jelekre. Emberben az ankyrin ismétlődések jelenléte helyettesítette a baktériumokban és gombákban található két ATPáz domén közül az elsőt, amelyek a bonyolultabb szubsztrátfelismerés biztosítása vagy a feltételezett chaperone funkció támogatása érdekében alakulhattak ki . Vagy az ankyrin ismétlések önmagukban, vagy az AAA+ domain nem volt elegendő a bontási tevékenység támogatásához. Az egyetlen ATP -áz doménnel rendelkező Skd3 feltételezetten alkalmas az ATP hidrolízis energiájának felhasználására a széthajtott polipeptidek hexamergyűrű központi csatornáján keresztül történő befűzésére . />

Klinikai jelentőség

Az újszülöttkori encephalopathia egyfajta súlyos idegrendszeri károsodás az újszülöttben, és az élet korai szakaszában nincs specifikus klinikai jele, és diagnózisa továbbra is kihívás. Ez az újszülöttkori encephalopathia magában foglalja a 3-metil-glutakonsav-aciduria szindrómák heterogén csoportját, és a Skd3 funkció elvesztése az egyik ok. A zebrahalban a clpB gén leütése csökkentette a növekedést és fokozta a motoros aktivitást, ami hasonló a betegeknél megfigyelt tünetekhez . Elvesztése széles fenotípusos spektrumhoz vezethet, ideértve az értelmi fogyatékosságot/fejlődési késedelmet, a veleszületett neutropeniát, a progresszív agyi atrófiát, a mozgászavarokat és a kétoldalú szürkehályogot, valamint a 3-metil-glutakonsavatúrát. Az Skd3 további vizsgálata új megvilágításba helyezheti e betegség diagnózisát.

Interakciók

Ez a fehérje köztudottan kölcsönhatásba lép:

Hivatkozások

Külső linkek

További irodalom