Ligase - Ligase

Ez a cikk az általános ligázokról szól. A DNS-specifikus ligázokról lásd a DNS-ligázt .

A biokémiában a ligáz olyan enzim , amely új kémiai kötés kialakításával képes katalizálni két nagy molekula csatlakozását ( ligálását ) . Ez általában egy kis függő kémiai csoport hidrolízisével történik a nagyobb molekulák egyikén, vagy az enzim, amely két vegyület összekapcsolását katalizálja, pl. Enzimek, amelyek katalizálják a CO, CS, CN összekapcsolódását stb. Általában egy ligáz katalizálja a következő reakció:

Ab + C → A – C + b

vagy néha

Ab + cD → A – D + b + c + d + e + f

ahol a kisbetűk a kis, függő csoportokat jelenthetik. A ligáz összekapcsolhatja a nukleinsav két komplementer fragmentumát, és helyrehozhatja az egyszálú töréseket, amelyek a kétszálú DNS-ben keletkeznek a replikáció során.

Elnevezéstan

A ligázok közönséges neve gyakran tartalmazza a "ligáz" szót, például a DNS-ligázt , egy enzimet, amelyet a molekuláris biológiai laboratóriumokban gyakran használnak a DNS- fragmensek összekapcsolására . A ligázok egyéb elterjedt nevei között szerepel a "szintetáz" szó, mert új molekulák szintetizálására szolgálnak .

A biokémiai nómenklatúra néha megkülönbözteti a szintetázokat a szintázoktól, és néha szinonimaként kezeli a szavakat . Az egyikben meghatározás szintázok ne használjon energiát nukleozid-trifoszfát (ATP, mint, GTP, CTP, TTP és UTP), míg szintetázokkal csinálni használatra nukleozid-trifoszfát. Azt is mondják, hogy a szintáz egy liáz (a liáz egy olyan enzim, amely a különböző kémiai kötések megszakadását hidrolízistől és oxidációtól eltérő módon katalizálja, gyakran új kettős kötést vagy új gyűrűszerkezetet képez), és nem igényel energiát. , míg a szintetáz egy ligáz (a ligáz egy enzim, amely két vegyszert vagy vegyületet köt meg), és ezért energiára van szükség. A Biokémiai Nómenklatúra Közös Bizottsága (JCBN) azonban előírja, hogy a "szintáz" bármilyen enzimmel használható, amely katalizálja a szintézist (függetlenül attól, hogy nukleozid-trifoszfátokat használ-e), míg a "szintetázt" szinonimán kell használni.

Osztályozás

Ligázok minősülnek EC 6 az EK-szám besorolása enzimeket. A ligázok további hat alosztályba sorolhatók:

Membránhoz kapcsolódó ligázok

Egyes ligázok a biológiai membránokhoz kapcsolódnak, mint perifériás membránfehérjék, vagy egyetlen transzmembrán hélixen keresztül horgonyoznak , például bizonyos ubiquitin ligázzal kapcsolatos fehérjék.

Etimológia és kiejtés

A szó ligáz felhasználása kombinálásával formái a lig- (a latin ige ligāre , „a bind” vagy „kötni együtt”) + -ase (jelölő egy enzim), így „kötő enzim”.

Lásd még

Hivatkozások