23S riboszómális RNS - 23S ribosomal RNA

23S és 5S riboszómális RNS -ek
E coli LSU Kontúrvonal Szín.png
23S és 5S rRNS -ek, amelyek nukleotidszámokat, hélixszámokat és doméneket jeleznek
Azonosítók
Egyéb adatok
RNS típus Gén ; rRNS
Domain (ek) Baktériumok
ÍGY SO: 0001263
PDB struktúrák PDBe
A riboszóma 3D ábrázolása. Ez a 23S és 5S rRNS 3D elrendezésének nézete az Escherichia coli 50S riboszómális alegységben, krioelektron mikroszkópos rekonstrukció alapján .

A 23S rRNS a bakteriális/archean riboszóma nagy alegységének ( 50S ) 2904 nukleotid hosszú ( E. coliban ) összetevője, és a peptidil -transzferáz központot (PTC) alkotja. A 23S rRNS hat másodlagos strukturális doménre van osztva, I-VI címmel, a megfelelő 5S rRNS-t VII. Doménnek tekintjük. A riboszómális peptidil -transzferáz aktivitás ennek az rRNS -nek az V. doménjében található, amely a transzlációt gátló antibiotikumok leggyakoribb kötőhelye is, így a riboszóma -technika célpontja. Ennek az antibiotikum-osztálynak egy jól ismert tagja, a kloramfenikol gátolja a peptidkötések képződését, a közelmúltbeli 3D-szerkezeti vizsgálatok két különböző kötési helyet mutattak be a riboszóma fajtájától függően. A 23S rRNS peptidtranszferáz aktivitással rendelkező doménjeiben számos mutáció eredményezett antibiotikum rezisztenciát. A 23S rRNS gének jellemzően magasabb szekvencia variációkkal rendelkeznek, beleértve az inszerciókat és/vagy deléciókat, mint más rRNS -ek.

A 23S LSU rRNS eukarióta homológja a 28S riboszómális RNS , amelynek régiója az 5.8S riboszómális RNS -sel van kitöltve .

23S rRNS funkciók

Általában az rRNS alapvető funkciója a peptidil -transzferáz. A riboszóma stimuláló magja szerepet játszik a peptidkötés konfigurációjában. Mind a peptidil-tRNS, mind az aminoacil-tRNS fontos a fehérjeszintézis és a transzpeptidációs válasz szempontjából. Mindazonáltal a 23S rRNS -pozíciók (G2252, A2451, U2506 és U2585) jelentős funkcióval rendelkeznek a tRNS -kötéshez a nagy riboszómális alegység P -helyén. Ezek a módosító nukleotidok a P helyen gátolhatják a peptidil-tRNS kötődését. Az U2555 módosítás beavatkozhat a peptidil-tRNS puromicinbe történő átvitelével is. Továbbá ezen G2251, G2253, A2439 és U2584 pozíciók felének kémiai módosítása nem tudja megakadályozni a tRNS -kötést. Az 50S alegységek peptidil-tRNS-e, amely a P-helyhez kötődik, megőrzi a 23S rRNS nyolc pozícióját a kémiai módosításoktól. Másrészt a 23S rRNS mutációja szintén hatással lehet a sejtek növekedésére. Az A1912G, A1919G és Ψ1917C mutációk erőteljes növekedési fenotípusokkal rendelkeznek, és megakadályozzák a transzlációt, míg az A1916G mutációnak egyszerű növekedési fenotípusa van, és az 50S alegységek hibájához vezet.

Lásd még

Hivatkozások

Külső linkek