Biológiai minta - Biological specimen
A biológiai minta (más néven biospepimenta ) egy biológiai laboratóriumi minta , amelyet egy biotárház tart kutatáshoz. Az ilyen mintát mintavétellel kell venni , hogy reprezentatív legyen a minta forrásából vett bármely más minta esetében. Ha a biológiai mintákat tárolják, ideális esetben a kutatás céljából egyenértékűek maradnak a frissen gyűjtött mintákkal.
Az emberi biológiai minták tárolása egy típusú biorepository úgynevezett biobankot , és a tudomány a megőrzése biológiai minták a legaktívabb területén biobanking.
Minőség ellenőrzés
A biológiai minták minőségére vonatkozó széles körű szabványok felállítása kezdetben a biobank növekedésének fejletlen aspektusa volt. Jelenleg vita folyik arról, hogy milyen szabványokat kell bevezetni, és kik kezelik ezeket a szabványokat. Mivel sok szervezet meghatározza saját szabványait, és mivel a biobankot szükségszerűen több szervezet használja, és jellemzően a bővítés felé hajlik, a laboratóriumi gyakorlatok szabványos működési eljárásainak összehangolása kiemelt fontosságú. Az eljárásoknak bizonyítékokon kell alapulniuk, és idővel változni fognak, amint új kutatások és technológiák állnak rendelkezésre.
Döntéshozók
Némi előrelépés a politikai döntéshozó szervezetek létrehozása terén a Nemzeti Rákkutató Intézet 2005-ben létrehozott Biobank és Biospecimen Kutatási Irodája (OBBR), valamint az éves Biospecimen Research Network Symposio. A Nemzetközi Biológiai és Környezeti Adattárak Társasága , a Nemzetközi Rákkutató Ügynökség, a Gazdasági Együttműködési és Fejlesztési Szervezet és az Ausztráliai Biospecimen Network szintén javaslatot tett politikákra és szabványokra. 2008-ban az AFNOR francia szabványügyi szervezet közzétette az első biobankspecifikus minőségi szabványt. Az ISO 9000 szempontjait alkalmazták a biobankokra.
Minőségi célok
A minták minőségi kritériumai a vizsgált tanulmánytól függenek, és nem létezik univerzális standard mintatípus. A DNS integritása fontos tényező a teljes genom amplifikációját magában foglaló vizsgálatokban. Az RNS integritása kritikus néhány tanulmány esetében, és gél elektroforézissel értékelhető . A minta tárolását végző biobankok sem vállalhatnak teljes felelősséget a minta integritásáért, mert mielőtt a mintákat őrizetbe vennék, valakinek össze kell gyűjtenie és fel kell dolgoznia azokat, és az olyan hatások, mint az RNS lebomlása, nagyobb valószínűséggel jelentkeznek a késleltetett mintafeldolgozásból, mint a nem megfelelő tárolásból.
Minták tárolva
A bioraktárak különböző típusú mintákat tárolnak. A különböző minták különböző célokra hasznosak.
Biobank minták | ||||
---|---|---|---|---|
mintadarab | felhasznál | kivonási technika | tárolás | jellemzők |
arcát szövet | DNS -profilozás | bukk | a résztvevők összeszedhetik magukat; postán átvehető; olyan könnyű begyűjteni, hogy a tájékozott beleegyezést nem lehet megfelelően kezelni | |
egész vér | venipunktúra | megköveteli phlebotomist gyűjteni | ||
Szárított vérfolt | kiváló minőségű DNS -t és RNS -t ad | Ujjbot | könnyen tárolható évekig szobahőmérsékleten | |
szervi szövet | kiváló minőségű DNS -t , RNS -t , mitokondriális DNS -t és a betegség forrását adja | Biopszia | sok vérrel megosztott felhasználás; proteomikai elemzésre is alkalmas ; nehéz lehet beszerezni | |
Vérplazma | korlátozott DNS- és RNS -tartalom | A vérplazma frakcionálása | megköveteli phlebotomist gyűjteni | |
Vizelet | marker néhány diagnosztikai vizsgálathoz | Vizelés | nem invazív | |
Ürülék | marker néhány diagnosztikai vizsgálathoz | Székletminta | nem invazív | |
Bőr | Leginkább a bűnügyeket vizsgáló törvényszéki csoportok használják | büntetőügyekben az adományozó hozzájárulása nélkül gyűjtötték össze | ||
Haj | Leginkább a bűnügyeket vizsgáló törvényszéki csoportok használják | Haj elemzés | büntetőügyekben az adományozó hozzájárulása nélkül gyűjtötték össze |
Tárolási technikák
Sok példányok biobankok mélyhűtéséről . Más mintákat más módon tárolnak.
A biobankkal kapcsolatos technikák
A biológiai mintatároláshoz kapcsolódó laboratóriumi technikák közül néhány a fenol-kloroform extrakció , a PCR és az RFLP .
Hivatkozások
Külső linkek
- Biospecimen kutatási adatbázis , a biospecimensről szóló cikkek kurátora
- Biorepositóriumok és Biospecimen Research
- Minta Központi bioraktárak listája , Az aktív biobankok és bioraktárak világszerte felsorolt listája
- Biospecimen Research Network Symposia , konferencia a biobanki mintákról
- Mayo Clinic a biobankkal kapcsolatban
- Rövid köztévé -epizód a múzeumi gyűjteményekről