Naplócikk -címkecsomag - Journal Article Tag Suite

A "JATS" átirányít ide. A többi felhasználásról lásd: Jat (egyértelműsítés) .
Jats-logo.jpg
Állapot Közzétett
Először publikált 2003. március 31 ( 2003-03-31 )
Legújabb verzió NISO JATS 1.2,
2019. február 8 ( 2019-02-08 )
Szervezet
Szerzői
Alapszabványok XML
Kapcsolódó szabványok
Tartomány
Rövidítés JATS
Weboldal jats .nlm .nih .eu

A Journal Article Tag Suite ( JATS ) egy XML formátum, amely az online publikált tudományos irodalom leírására szolgál . Ez egy műszaki szabvány , amelyet a Nemzeti Információs Szabványügyi Szervezet (NISO) dolgozott ki, és amelyet az Amerikai Nemzeti Szabványügyi Intézet Z39.96-2012 kóddal hagyott jóvá .

A NISO projekt az NLM/NCBI munkájának folytatása volt , és az NLM PubMed Central népszerűsítette, mint de facto szabványt a tudományos nyílt hozzáférésű folyóiratok és tartalmuk XML -re történő archiválására és cseréjére .

A NISO szabványosítással az NLM kezdeményezés szélesebb körűvé vált, és számos más adattár, például a SciELO és a Redalyc elfogadta a tudományos cikkek XML formátumát .

A JATS XML elemeket és attribútumokat tartalmaz a folyóiratcikkek szöveges és grafikai tartalmának leírására, valamint néhány nem cikkből származó anyagot, például leveleket, szerkesztőségeket, valamint könyv- és termékértékeléseket. A JATS lehetővé teszi a cikk teljes tartalmának vagy csak a cikk fejlécének metaadatainak leírását; és más típusú tartalmakat is lehetővé tesz, beleértve a kutatási és nem kutatási cikkeket, leveleket, szerkesztőségeket, valamint a könyvekről és a termékekről szóló véleményeket.

Történelem

Bevezetése óta az NCBI NLM Archiválás és Interchange DTD csomagja a tudományos kiadói folyóiratcikk -jelölés de facto szabványává vált . A NISO JATS bevezetésével igazi színvonalra emelkedett . Nyilvános adatcsere nélkül is a NISO JATS elfogadásának előnyei biztosítják a kiadóknak a termelési munkafolyamatok egyszerűsítését és a rendszerek interoperabilitásának optimalizálását.

Idővonal

NLM JATS
NLM JATS, 1. verzió
  • 2003. március 31 .: Az NLM DTD v1.0 bevezetése. ( 2003-03-31 )
  • 2003. november 5 .: Megjelent az 1.1 -es verziójú frissítés. ( 2003-11-05 )
NLM JATS, 2. verzió
  • 2004. december 30 . : Megjelent a 2.0 -ás fő frissítés. Úgy tervezték, hogy támogassa a testreszabási legjobb gyakorlatokat. ( 2004-12-30 )
  • 2005. november 14 . : Megjelent a 2.1 -es verziójú frissítés a cikkszerző DTD kiegészítésével . ( 2005-11-14 )
  • 2006. június 8 . : Megjelent a 2.2 -es verziójú frissítés. ( 2006-06-08 )
  • 2007. március 28 . : Megjelent a 2.3 -as verziójú frissítés. ( 2007-03-28 )
NLM JATS, 3. verzió
  • 2008. november 21 . : Megjelent a 3.0 -ás fő frissítés. ( 2008-11-21 )
NISO JATS
NISO JATS, 1.0 verzió
  • 2011. március 30. - 2011.  szeptember 30 .: Az első vázlat, a NISO Z39.96.201x 0.4 verziója megjelent; hat hónapos hozzászólási időszak. ( 2011-03-30 ) ( 2011-09-30 )
  • 2012. július 15 . : A NISO JATS, v1.0 NISO jóváhagyást kapott. ( 2012-07-15 )
  • 2012. augusztus 9 . : A NISO JATS, v1.0 ANSI jóváhagyást kapott. ( 2012-08-09 )
  • 2012. augusztus 22 .: ANSI/NISO Z39.96-2012, JATS: Journal Article Tag Suite (1.0 verzió). Teljes mértékben visszafelé kompatibilis az NLM JATS v3.0-val. ( 2012-08-22 )
NISO JATS, 1.1 verzió
  • 2013. december 9 . : Megjelent az első vázlat, a NISO JATS, v1.1d1. ( 2013-12-09 )
  • 2014. december 29 . : Megjelent a második vázlat, NISO JATS, v1.1d2. ( 2014-12-29 )
  • 2015. április 14 . : Megjelent a harmadik vázlat, NISO JATS, v1.1d. ( 2015-04-14 )
  • 2015. október 22 . : A NISO JATS, v1.1 NISO jóváhagyást kapott. ( 2015-10-22 )
  • 2015. november 19 . : A NISO JATS, v1.1 ANSI jóváhagyást kapott ( 2015-11-19 )
  • 2016. január 6 . : ANSI/NISO Z39.96-2015, JATS: Journal Article Tag Suite, 1.1 verzió. ( 2016-01-06 )
NISO JATS, 1.2 verzió
  • 2017. július 20 . : Megjelent az első vázlat, NISO JATS, v1.2d1. ( 2017-07-20 )
  • 2018. május 23 . : Megjelent az első vázlat, a NISO JATS, v1.2d2. ( 2018-05-23 )
  • 2019. február 8 . : ANSI/NISO Z39.96-2019, JATS: Journal Article Tag Suite, 1.2 version. ( 2019-02-08 )
NISO JATS, 1.3 verzió
  • 2021. július 7 .: ANSI/NISO Z39.96-2021, JATS: Journal Article Tag Suite, 1.3 version. ( 2021-07-07 )

Műszaki hatály

Ez a modell a folyóiratcikkek modellje, például az STM folyóiratban található tipikus kutatási cikk , és nem a teljes folyóiratok modellje.

Címkehalmazok

A 3 specifikáció. Színkódolt dokumentációjuk miatt a köznyelvben szín szerint hivatkoznak rájuk.

Három címkekészlet létezik:

Napló archiválása és cseréje ( zöld )
"A leginkább megengedő címkekészletek", elsősorban a meglévő naplóadatok rögzítésére és archiválására szolgálnak.
Journal Publishing ( Blue )
"Mérsékelten előíró címkekészlet", amelyet a folyóiratgyártásban és -kiadásban általában használnak.
Formálisan ez a modell az archiválási modell részhalmaza . Ez a leggyakrabban használt JATS változat.
Cikk szerzői ( Orange )
"A címkehalmazok közül a legmeghatározóbb [legszűkebb és legkisebb]", a JATS -ra érvényes folyóiratcikkek viszonylag könnyű létrehozására szolgál.
Formálisan ez a modell a Publishing modell részhalmaza .

A dokumentumtípus -definíciók (szintén RELAX NG és XML séma formájában kerülnek kiadásra ) meghatározzák az egyes halmazokat, és más szabványokat is tartalmaznak, mint például a MathML és az XHTML táblázatok (bár nem az XHTML névtérben ).

A dokumentum szerkezete

A JATS Publishing készlet egy olyan dokumentumot határoz meg, amely a folyóirat felső szintű összetevője, például cikk, könyv vagy termékismertető, vagy levél a szerkesztőnek. Minden ilyen dokumentum elülső anyagból (kötelező) és legfeljebb három opcionális részből áll. Ezeknek a következő sorrendben kell megjelenniük:

Elülső ügy
A cikk eleje tartalmazza a cikk metaadatait (más néven cikkfejléc -információkat), például a cikk címét, a folyóiratot, amelyben megjelenik, a folyóirat adott számának megjelenési dátumát és számát, szerzői jogi nyilatkozatot stb. Mind a cikkszintű, mind a probléma szintű metaadatok (az elemben <article-meta>) és a folyóirat-szintű metaadatok (az elemben <journal-meta>) rögzíthetők.
Törzs (a cikkből)
A cikk törzse a cikk fő szöveges és grafikus tartalma. Ez általában bekezdésekből és szakaszokból áll, amelyek maguk is tartalmazhatnak ábrákat, táblázatokat, oldalsávokat (dobozos szöveg) stb. A cikk törzse opcionális azoknak az adattáraknak a befogadására, amelyek csak a fejléc adatait őrzik, és nem címkézik a szöveges tartalmat.
Vissza ügy
Ha jelen van, a cikk hátulja a főszöveget kiegészítő információkat tartalmaz, például szószedetet, mellékletet vagy hivatkozott hivatkozások listáját.
Lebegő anyag
A kiadó dönthet úgy, hogy a cikk összes lebegő objektumát és annak hátulját (például táblázatokat, ábrákat, dobozos szöveges oldalsávokat stb.) Egy külön tárolóelembe helyezi a narratív folyamaton kívül a feldolgozás kényelme érdekében.

Az elülső, a hátsó, a hátsó és a lebegő anyagot követően egy vagy több válasz érkezhet a cikkre, vagy egy vagy több alárendelt cikk.

Példa

Ez a cikk minimális felépítése, 

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article
  PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.0 20120330//EN"
         "JATS-journalpublishing1.dtd"
>
<article dtd-version="1.0" article-type="article" specific-use="migrated"
 xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" 
>
  <front>...</front>
  <body>...</body>
  <back>...</back>
</article>

A DOCTYPEfejléc opcionális, az SGML és a DTD -orientált validátorok öröksége . Az dtd-versionattribútum DTD fejléc nélkül is használható.

A gyökér elem articleközös a JATS vagy a "JATS család" bármely verziójában, mint NLM DTD. A szabályokat front, bodyés backcímkék érvényesítés függ JATS verzió, de az összes verzió hasonló szerkezetű, jó kompatibilitás a legkülönbözőbb év. A séma fejlődése megőrzi az általános stabilitást.

Kevésbé gyakori, "csak front", "csak" frontés back"variációkat használnak más véglegességekhez is, mint a teljes tartalom megjelenítése. Az általános cikkösszetétel ( DTD-tartalmú kifejezésként ) az 

   (front, body?, back?, floats-group?, (sub-article* | response*))

Eszközök

A JATS létrehozásához, szerkesztéséhez, konvertálásához és átalakításához számos eszköz áll rendelkezésre. Az egyszerű formáktól a teljes konverziós automatizálásig terjednek:

Átalakítás JATS -ra

Vegyünk bemenetként egy tudományos dokumentumot, és némi emberi támogatással készítsünk JATS kimenetet.

  • OpenOffice ( LibreOffice ) és MS Word dokumentumok a JATS -hoz:
    • Típuskészlet: automatikus konverterek készletét biztosítja az MS-Word és a JATS XML között .
    • OxGarage : különféle formátumú dokumentumokat képes átalakítani "National Library of Medicine (NLM) DTD 3.0" -ra.
    • meTypeset : A meTypeset "az OxGarage verem" "villája, amely" Microsoft Word .docx formátumból NLM/JATS-XML "formátumba konvertálható.
    • eXtyles : automatizálja a Microsoft Word dokumentumszerkesztésének időigényes aspektusait és a JATS XML-be (valamint sok más DTD-be) történő exportálást.
  • Árleszállítás a JATS: Pandoc 2,0 konvertálni számos bemeneti formátumok JATS.
  • PDF a JATS -hoz: ez egy nagyon nehéz probléma. A siker attól függ, hogy a PDF -ek mennyire vannak felépítve, és kötegelt konverzió esetén mennyire következetesek a PDF -ek.
    • Shabash Merops
    • Typeset a PDF JATS XML Converter
    • A Public Knowledge Project folyamatot fejleszt a PDF JATS formátumba konvertálására. Ez magában foglalja a pdfx használatát .
    • CERMINE Content ExtRactor és MINEr

Konvertálás a JATS -ból

Vegye figyelembe a JATS -t bemenetként, és készítsen más típusú dokumentumot kimenetként.

  • JATS -ról HTML -re
    • JATS előnézeti stíluslapok (kanonikus XSLT konverzió), lásd klasszikus (2013) konvertáló.
    • Az eLife Lens átalakítja az NLM XML -t JSON -ra HTML és Javascript használatával történő megjelenítéshez.
  • JATS-ból PDF-be: néhány JATS előnézeti stíluslap, XSLT + XSL-FO konverzió.
  • a JATS -ból az EPUB -ba.
  • Általános (a JATS DTD -től): DtdAnalyzer - hasonlítsa össze a JATS -t más DTD -kkel, és segítsen XML -reprezentáció, XSLT és Schematron generálás, valamint egyéb eszközök létrehozásában.

Szerkesztők

  • Typeset biztosít WYSIWYM szerkesztő tudományos cikkek. Támogatja az XML exportálást NISO JATS és NLM JATS szabványokban. Leginkább a folyóiratok és kiadók használják, amelyek a szerző által beküldött MS-Word fájlokat szeretnék XML, PDF, HTML és ePuB formátumra konvertálni.
  • JATS Framework for oXygen XML Editor: Az oXygen XML Editor és az oXygen XML Author felhasználók mostantól telepíthetik a NISO JATS jelenlegi verzióinak támogatását (és bónuszként az NLM BITS). A DOCTYPE deklarációban megadott azonosító alapján az oXygen észleli, hogy JATS dokumentumot szerkeszt, és stíluslapokat és segédprogramokat biztosít.
  • FontoXML JATS számára: WYSIWYS szerkesztő a JATS tartalom szerkesztéséhez és felülvizsgálatához:
  • PubRef "Pipeline": Böngészőalapú valós idejű előnézeti JATS-szerkesztő:
  • Annotum : egy WordPress téma, amely WYSIWYG szerzői JATS (Kipling részhalmaz), szakértői felülvizsgálat és szerkesztési menedzsment, valamint közzététel.
  • JATS kiadás webalapú XML szerkesztő Xeditor .
  • Az Anyagkonzorcium textúraszerkesztője. Az első online "született JATS" szerkesztő.
  • Az eLife által kifejlesztett Libero Editor úgy írja le magát, mint „Felhasználóbarát szerkesztőfelület a kiadói személyzet és a szerzők számára kiváló minőségű JATS XML előállításához”.

Előnézet

Eszközök, amelyek JATS -t HTML -ként jelenítik meg, általában menet közben.

  • JATS előnézeti stíluslapok: A JATS előnézeti stíluslapok .xsl, .xpl, .css és .sch fájlok, amelyek létrehozzák az érvényes NISO Z39.96-2012 JATS 1.0 fájlok .html vagy .pdf verzióit. Elsősorban a kiadók belső használatra szánt, és testreszabási alap.
  • Típuskészlet - Lehetővé teszi HTML előállítását a JATS XML -ből egy kattintáson belül. Ezenkívül kapacitást kínál egyéni HTML létrehozására a napló követelményei alapján.
  • PubReader - "A PubReader nézet alternatív webes prezentáció ... A kifejezetten táblagépeken és más kis képernyős eszközökön való olvashatóság javítására tervezett PubReader asztali számítógépeken és laptopokon, valamint több webböngészőből is használható".

Testreszabás

  • Jatsdoc - Dokumentációt készít a JATS testreszabásához. A Jatsdoc integrálva van az NCBI DtdAnalyzer készülékével .

JATS központi adattárak

Amint a NISO JATS megkezdte a nyílt hozzáférésű folyóiratok de facto és de jure szabványát , a tudományos közösség a JATS adattárait egyfajta kötelező letétként fogadta el , néha értékesebbnek tekintve, mint a hagyományos digitális könyvtárak, ahol csak a PDF változatot tárolják. A nyílt tudásnak gazdagabb és strukturáltabb formátumokra van szüksége, mint a JATS -nak: a PDF -et és a JATS -t "azonos tartalomnak" kell tanúsítani, és a "PDF+JATS" halmaznak, amely a kötelező letét egységét képezi. A JATS adattárak listája és azok tartalma:

Ezek az adattárak átfedik egymást, és ugyanazt a cikket több tároló is tárolhatja.

Alternatívák és szemantikai

Vannak erőfeszítések és kísérletek az RDF átalakításával a 2012 -es évben, amelyek nincsenek hatással a JATS közösségre.

Később, ~ 2016 -ban, a Semantic Web kontextusban, a SchemaOrg kezdeményezéssel a ScholarlyArticle osztályt definiálták, jobb vételt kapva. Ez egy kezdeti "JATS-szerű szabványosítás" az RDF felhasználási környezetekben.

Lásd még

Kapcsolatos

Használja (digitális megőrzés)

Használja (kiadó)

Hasonló

Hivatkozások

További irodalom

Külső linkek