Pelagibacterales - Pelagibacterales
| " Pelagibacterales " | |
|---|---|
| Tudományos osztályozás | |
| Tartomány: | |
| Törzs: | |
| Osztály: | |
| Alosztály: | |
| Rendelés: |
" Pelagibacterales "
Grote és mtsai . 2012
|
| Családok | |
|
|
| Szinonimák | |
|
|
A Pelagibacterales egy rend az Alphaproteobacteria-ban, amely szabadon élő tengeri baktériumokból áll , amelyek nagyjából minden harmadik sejtet alkotnak az óceán felszínén. Összességében a Pelagibacterales tagjai a becslések szerint az óceán összes prokarióta sejtjének negyedét és felét teszik ki .
Kezdetben ezt a taxont kizárólag metagenomikai adatok ismerték, és SAR11 klád néven ismerték . Ez volt az első helyezett a Rickettsiales, de később rangot a rend , és ezután a nővére, hogy a Rickettsiales az alosztály Rickettsidae. Ide tartozik a rendkívül bőséges tengeri faj, a Pelagibacter ubique .
Ebben a sorrendben a baktériumok szokatlanul kicsik. Kicsi genomméretük és korlátozott anyagcsere -funkciójuk miatt a Pelagibacterales a „ racionalizáló elmélet ” mintaorganizmusává vált .
A P. ubique és a rokon fajok oligotrófok (tisztítók), és oldott szerves szénből és nitrogénből táplálkoznak. Képtelenek fix szén- vagy nitrogén, de végre tudja hajtani a trikarbonsavciklusban a glioxilát bypass és képesek szintetizálni kivételével valamennyi aminosav glicin, valamint néhány cofactors. Szokatlan és váratlan követelményük van a csökkentett kéntartalomra is.
A P. ubique és az I. óceáni alcsoport tagjai glükoneogenezissel rendelkeznek , de nem tipikus glikolízis útvonallal, míg más alcsoportok képesek tipikus glikolízisre.
Ellentétben Acaryochloris Marina , P. ubique nem fotoszintetikus - specifikusan, nem használ fényt, hogy növelje a kötés energiája egy elektronpár - de ez nem rendelkezik proteorhodopsin (beleértve retinol bioszintézisének) számára ATP termelést fénytől.
A SAR11 baktériumok felelősek az óceán felszínén oldott metán nagy részéért . Foszfátot vonnak ki metil -foszfonsavból .
Bár a taxon a nevét a P. ubique fajfajtából (státus Candidatus faj) kapta , ezt a fajt még nem tették közzé érvényesen, ezért sem a rend, sem a faj neve nem rendelkezik hivatalos rendszertani állománnyal.
Alcsoportok
Jelenleg a rendelés öt alcsoportra oszlik:
- Ia. Alcsoport, nyílt óceán, koronacsoport - a P. ubique HTCC1062
- Ib alcsoport, nyílt óceán, Ia testvérkládja
- II. Alcsoport, tengerparti, bazális az Ia + Ib
- III. Alcsoport, sós, bazális az I + II -hez, a IV. Kládjával együtt
- IV. Alcsoport, más néven LD12 klád, édesvíz
- Az V. alcsoport, amely tartalmazza a HIMB59 alfaproteobaktériumot, a többihez képest bazális
A fentiek eredményeként a Pelagibacterales kladogramja a következő:
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
V. alcsoport (tartalmazza a HIMB59 α-proteobaktériumot) |
|||||||||||||||||||||||||||||||
Filogenetikai elhelyezés és endoszimbiotikus elmélet
A Mānoa Hawaii Egyetem és az Oregon State University kutatói 2011 -es tanulmánya szerint a SAR11 a mitokondriumok őse lehet a legtöbb eukarióta sejtben. Ez az eredmény azonban egy fa rekonstrukciós műterméket képviselhet a kompozíciós torzítás miatt.
| Az Alphaproteobacteria vázlatos riboszómális RNS filogenetikája | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A Rickettsidae kladogramjára Ferla et al. a 16S + 23S riboszómális RNS szekvenciák összehasonlításából . |