12. kromoszóma - Chromosome 12
12. kromoszóma | |
---|---|
Jellemzők | |
Hossz ( bp ) | 133 275 309 bp ( GRCh38 ) |
No. gének | 988 ( CCDS ) |
típus | Autoszóma |
Centromere pozíció |
Szubmetacentrikus (35,5 Mbp) |
Teljes génlisták | |
CCDS | Génlista |
HGNC | Génlista |
UniProt | Génlista |
NCBI | Génlista |
Külső térképnézegetők | |
Ensembl | 12. kromoszóma |
Entrez | 12. kromoszóma |
NCBI | 12. kromoszóma |
UCSC | 12. kromoszóma |
Teljes DNS szekvencia | |
RefSeq | NC_000012 ( FASTA ) |
GenBank | CM000674 ( FASTA ) |
Kromoszóma 12 egyike a 23 pár kromoszómát az emberben . Az embereknek általában két példányuk van ebből a kromoszómából. A 12. kromoszóma körülbelül 133 millió bázispárt foglal magában (a DNS építőanyaga ), és a sejtek teljes DNS -ének 4-4,5 százalékát teszi ki .
A 12. kromoszóma tartalmazza a Homeobox C géncsoportot.
Gének
A gének száma
Az alábbiakban néhány, a humán 12. kromoszóma génszámra vonatkozó becsléseit mutatjuk be. Mivel a kutatók különböző megközelítéseket alkalmaznak a genom annotálásához , az egyes kromoszómák génjeire vonatkozó előrejelzéseik eltérőek (technikai részletekért lásd a gén előrejelzését ). A különböző projektek közül az együttműködő konszenzus kódoló szekvencia projekt ( CCDS ) rendkívül konzervatív stratégiát alkalmaz. Tehát a CCDS génszám-előrejelzése a humán fehérjét kódoló gének teljes számának alsó határát képviseli.
Becslés szerint | Fehérjét kódoló gének | Nem kódoló RNS gének | Pseudogenes | Forrás | Kiadási dátum |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 988 | - | - | 2016-09-08 | |
HGNC | 995 | 318 | 545 | 2017-05-12 | |
Ensembl | 1033 | 1202 | 617 | 2017-03-29 | |
UniProt | 1032 | - | - | 2018-02-28 | |
NCBI | 1036 | 853 | 693 | 2017-05-19 |
Génlista
Az alábbiakban a humán 12. kromoszóma génjeinek részleges listája található. A teljes listát lásd a jobb oldali infoboxban található linken.
- ACAD10 : kódoló fehérje Acyl -CoA dehidrogenáz család, 10. tag
- ACSS3 : Acyl -CoA szintetáz fehérjét kódoló rövidláncú családtag 3
- ACVRL1 : aktivin A receptor II típusú szerű 1f
- ANKRD33 : Ankyrin ismétlődő domén 33 kódoló fehérje
- APOF : az Apolipoprotein F fehérjét kódoló
- APOLD1 : 1 -et tartalmazó apolipoprotein L domén
- ARL6IP4 : kódolja a fehérje ADP-ribozilációhoz hasonló 6. faktor kölcsönhatásba lépő fehérjét 4
- ARPC3 : kódoló fehérje Aktinhoz kapcsolódó fehérje 2/3 komplex alegysége 3
- Asun : kódoló fehérjefehérje homológ alatt (Asun)
- ATG101 : Autofágiával kapcsolatos fehérje 101
- BCAT1 : kódoló fehérje Elágazó láncú aminosav transzamináz 1
- C12orf42 : fehérjét nem kódoló 12. kromoszóma nyitott leolvasási keret 42
- C12orf43 : fehérjét kódoló. Jellemtelen.
- C12orf60 : kódoló fehérje nem jellemzett fehérjét C12orf60
- CALCOCO1 : Kalcium-kötő és tekercselt tekercs domént tartalmazó fehérje 1
- CBX5 : kromobox homológ 5
- CCDC53 : Tekercselt tekercs domént tartalmazó fehérje 53
- CKAP4 : A citoszkeletonhoz kapcsolódó fehérje 4
- CNOT2 : fehérje CCR4-NOT transzkripciós komplex 2. alegysége
- CNPY2 : kódoló fehérje Canopy FGF jelátviteli szabályozó 2
- CCDC42B : kódoló fehérje Coiled Coil Domain, amely 42B fehérjét tartalmaz
- COL2A1 : kollagén, II. Típusú, alfa 1 (primer osteoarthritis, spondyloepiphyseal dysplasia, veleszületett)
- CRACR2A : kódoló fehérje Kalcium felszabadulás aktivált csatorna szabályozó 2A
- CSRP2 : Cisztein és glicinben gazdag fehérje 2
- DDX23 : DEAD-box helikáz 23
- DDX47 : DEAD-box helikáz 47
- DHH : Sivatagi sündisznó fehérje
- DPPA3 : Fejlődési pluripotencia-asszociált fehérje 3
- DPY19L2 : Dpy-19-szerű 2 fehérjét kódoló (C. elegans)
- E2F7 : E2F transzkripciós faktor 7
- EMP1 : Epithelialis membrán fehérje 1
- ERGIC2 : 377 aminosavból álló fehérjét kódoló fehérje
- FAM60A: FAM60A fehérjét kódoló
- FAM186B : kódoló fehérje Protein FAM186B
- GPD1 : a glicerin-3-foszfát-dehidrogenáz 1 fehérjét kódolja
- GOLT1B : Golgi szállítás 1B
- GPN3 : a GPN-hurok GTPáz 3 enzimet kódoló enzim
- HNF1A-AS1 : HNF1A fehérjét kódoló antiszensz RNS 1
- HPD : 4-hidroxi-fenil-piruvát-dioxigenáz
- IFFO1 : fehérjét kódoló közbenső szálak családja árva 1
- KANSL2 : kódoló fehérje KAT8 szabályozó NSL komplex 2. alegység (KANSL2)
- KCNA1 : kálium feszültségfüggő csatorna A alcsalád 1. tagja, 12p13.32
- KDM2B : lizin (K) -specifikus demetiláz 2B fehérjét kódoló
- KERA : keratocan
- KRAS : V-Ki-ras2 Kirsten patkány szarkóma vírus onkogén homológ
- LARP4 : kódoló fehérje La-rokon fehérje 4
- LEPREL2 : Prolyl 3-hidroxiláz 3 kódoló enzim
- LMBR1L : kódoló fehérje Protein LMBR1L
- LRRC23 : kódoló fehérje Leucinban gazdag ismétlődő fehérjét 23
- LRRIQ1 : fehérjét kódoló, leucinban gazdag ismétlődések és 1-et tartalmazó IQ motívum
- LRRK2 : leucinban gazdag ismétlődő kináz 2
- MBOAT5 : Lizofoszfolipid -aciltranszferáz 5 enzimet kódoló enzim
- METTL1 : tRNS enzimet kódoló (guanin-N (7)-)-metiltranszferáz
- MFAP5 : fehérjét kódoló mikrofibrilláris asszociált fehérje 5
- MIR196A2 : mikroRNS mikroRNS 196a-2 kódolása
- MMAB : metil -malonsavas aciduria (kobalaminhiány) cblB típus
- MON2 : kódoló fehérje Protein MON2 homológ
- MUCL1 : kódoló fehérje Mucin-szerű fehérje 1
- MYO1A : miozin IA
- NANOG : NK-2 típusú homeodomain gén
- NAP1L1 : kódoló fehérje Nukleoszóma összeszerelő fehérje 1-szerű 1
- NRIP2 : kódoló fehérje Nukleáris receptorokkal kölcsönhatásba lépő fehérje 2
- NUDT4 : Diphosphoinositol -polifoszfát -foszfo -hidroláz enzimet kódoló 2
- PAH : fenilalanin -hidroxiláz
- PIP4K2C : fehérjét kódoló foszfatidil-inozitol-5-foszfát 4-kináz, II. Típusú, gamma
- PIWIL1 : fehérje kódolása Piwi-szerű fehérje 1
- POP5 : a ribonukleáz P/MRP fehérje alegységet kódoló enzim POP5
- PPHLN1 : Periphilin-1 fehérjét kódoló
- PPP1R12A : fehérje -foszfatáz 1, szabályozó (inhibitor) subungfdit 12A
- PRB1 : fehérjét kódoló Bázikus nyálprolinban gazdag fehérje 1
- PRB3 : fehérjét kódoló Bázikus nyálprolinban gazdag fehérje 3
- PRB4 : fehérjét kódoló Bázikus nyálprolinban gazdag fehérje 4
- PZP : kódoló fehérje Terhességi zóna fehérje
- PRH1 : kódoló fehérje Nyálban savas, prolinban gazdag foszfoprotein 1/2
- PRH2 : kódoló fehérje Prolinban gazdag fehérje HaeIII 2. alcsalád
- PRR4 : kódoló fehérje Prolinban gazdag fehérje 4
- PTMS : Parathymosin fehérjét kódoló
- PTPN11 : fehérje tirozin-foszfatáz, nem receptor 11-es típus (Noonan-szindróma 1)
- PUS1 : a tRNS pszeudouridin szintáz A enzimet kódoló enzim
- PUS7L : a Pseudouridylate szintetáz 7 homológ fehérjét kódoló enzim
- RAB3IP : kódoló fehérje RAB3A-kölcsönhatásba lépő fehérje
- RASSF8 : fehérje Ras asszociációs domént tartalmazó fehérjét kódoló 8
- RASSF9 : fehérje Ras asszociációs domént tartalmazó fehérjét kódoló 9
- RERG : fehérje RAS-szerű, ösztrogén által szabályozott, növekedést gátló kódolója
- RNF34 : az E3 enzimet kódoló ubiquitin-protein ligáz RNF34
- SARNP : SAP tartományt tartalmazó ribonukleoprotein
- Serpina3f : kódoló fehérje szerin (vagy cisztein) peptidáz inhibitor, A klád, 3F tag
- SLC8B1 : oldott anyag hordozócsalád 8 tagú B1
- TBC1D15 : fehérjét kódoló TBC1 doméncsalád -tag 15
- TBX3 : fehérje T-box transzkripciós faktor 3 kódolása
- TCHP : kódoló fehérje Trichoplein keratin filamentumkötő fehérje
- TESPA1 : timocita fehérje kódolása , pozitív szelekció társul 1
- THAP2 : fehérjét kódoló THAP domént tartalmazó fehérje 2
- TMTC1 : transzmembrán és 1 -et tartalmazó tetratricopeptid fehérjét kódoló fehérje
- TMEM117 : fehérjét kódoló transzmembrán fehérje 117
- TRAFD1 : fehérjét kódoló TRAF típusú cinkujj domént tartalmazó fehérje 1
- TSFM : kódoló fehérje Ts nyúlási tényező, mitokondriális
- TWF1 : twinfilin-1
- UNQ1887 :
- USP52 : a PAB-függő poli (A) -specifikus ribonukleáz 2. alegységet kódoló enzim
- UTP20 : kódoló fehérje Kis alegység processomkomponens 20 homológ
- VEZT : a Vezatin fehérjét kódoló
- YAF2 : YY1 fehérjéhez társított 2. faktor kódolása
- ZCCHC8 : kódoló fehérje Cinkujj CCHC domént tartalmazó fehérje 8
- ZFC3H1 : kódoló fehérje Cink ujj C3H1 típusú
- ZNF26 : kódoló fehérje Cink ujjfehérje 26
- ZNF84 : kódoló fehérje Cink ujjfehérje 84
- ZNF268 : kódoló fehérje Cink ujjfehérje 268
- ZNF664 : kódoló fehérje Cink ujjfehérje 664
Betegségek és rendellenességek
A következő betegségek a 12. kromoszóma génjeihez kapcsolódnak:
- 2. típusú achondrogenesis
- kollagénopátia, II. és XI
- szaruhártya plana 2
- epizodikus ataxia
- örökletes vérzéses telangiectasia
- hipochondrogenezis
- Siemens ichthyosis bullosa
- A legkisebb diszplázia
- Kabuki szindróma
- fiatal felnőttkori cukorbetegség 3
- metilmalonsav
- narkolepszia
- nem szindrómás süketség
- Noonan szindróma
- Parkinson kór
- Pallister-Killian szindróma ( 12p tetrasomia )
- fenilketonuria
- spondyloepimetaphyseal dysplasia, Strudwick típus
- spondyloepiphyseal dysplasia congenita
- spondyloperipheral diszplázia
- Stickler -szindróma , ( COL2A1 -hez kapcsolódó)
- Dadogás
- Trióz -foszfát -izomeráz hiány
- tirozinémia
- Von Willebrand -betegség
Citogenetikai sáv
Chr. | Kar | Zenekar | ISCN kezdés |
ISCN megállás |
Alappárosítás kezdete |
Alappáros megálló |
Folt | Sűrűség |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
12 | o | 13.33 | 0 | 216 | 1 | 3.200.000 | gneg | |
12 | o | 13.32 | 216 | 345 | 3 200 001 | 5 300 000 | gpos | 25 |
12 | o | 13.31 | 345 | 633 | 5 300 001 | 10.000.000 | gneg | |
12 | o | 13.2 | 633 | 806 | 10 000 001 | 12.600.000 | gpos | 75 |
12 | o | 13.1 | 806 | 921 | 12 600 001 | 14.600.000 | gneg | |
12 | o | 12.3 | 921 | 1195 | 14 600 001 | 19.800.000 | gpos | 100 |
12 | o | 12.2 | 1195 | 1252 | 19 800 001 | 21 100 000 | gneg | |
12 | o | 12.1 | 1252 | 1526 | 21 100 001 | 26 300 000 | gpos | 100 |
12 | o | 11.23 | 1526 | 1655 | 26 300 001 | 27 600 000 | gneg | |
12 | o | 11.22 | 1655 | 1785 | 27 600 001 | 30.500.000 | gpos | 50 |
12 | o | 11.21 | 1785 | 1900 | 30 500 001 | 33 200 000 | gneg | |
12 | o | 11.1 | 1900 | 2015 | 33 200 001 | 35 500 000 | acen | |
12 | q | 11 | 2015 | 2116 | 35 500 001 | 37 800 000 | acen | |
12 | q | 12 | 2116 | 2562 | 37 800 001 | 46 000 000 | gpos | 100 |
12 | q | 13.11 | 2562 | 2706 | 46 000 001 | 48 700 000 | gneg | |
12 | q | 13.12 | 2706 | 2850 | 48 700 001 | 51 100 000 | gpos | 25 |
12 | q | 13.13 | 2850 | 3210 | 51 100 001 | 54.500.000 | gneg | |
12 | q | 13.2 | 3210 | 3383 | 54.500.001 | 56 200 000 | gpos | 25 |
12 | q | 13.3 | 3383 | 3498 | 56 200 001 | 57.700.000 | gneg | |
12 | q | 14.1 | 3498 | 3700 | 57.700.001 | 62.700.000 | gpos | 75 |
12 | q | 14.2 | 3700 | 3786 | 62.700.001 | 64 700 000 | gneg | |
12 | q | 14.3 | 3786 | 3959 | 64 700 001 | 67 300 000 | gpos | 50 |
12 | q | 15 | 3959 | 4203 | 67.300.001 | 71 100 000 | gneg | |
12 | q | 21.1 | 4203 | 4362 | 71 100 001 | 75 300 000 | gpos | 75 |
12 | q | 21.2 | 4362 | 4549 | 75 300 001 | 79 900 000 | gneg | |
12 | q | 21.31 | 4549 | 4837 | 79.900.001 | 86 300 000 | gpos | 100 |
12 | q | 21.32 | 4837 | 4894 | 86.300.001 | 88.600.000 | gneg | |
12 | q | 21.33 | 4894 | 5125 | 88.600.001 | 92 200 000 | gpos | 100 |
12 | q | 22 | 5125 | 5355 | 92 200 001 | 95 800 000 | gneg | |
12 | q | 23.1 | 5355 | 5571 | 95 800 001 | 101 200 000 | gpos | 75 |
12 | q | 23.2 | 5571 | 5643 | 101 200 001 | 103.500.000 | gneg | |
12 | q | 23.3 | 5643 | 5873 | 103.500.001 | 108 600 000 | gpos | 50 |
12 | q | 24.11 | 5873 | 6104 | 108 600 001 | 111 300 000 | gneg | |
12 | q | 24.12 | 6104 | 6219 | 111.300.001 | 111 900 000 | gpos | 25 |
12 | q | 24.13 | 6219 | 6334 | 111.900.001 | 113 900 000 | gneg | |
12 | q | 24.21 | 6334 | 6478 | 113 900 001 | 116 400 000 | gpos | 50 |
12 | q | 24,22 | 6478 | 6579 | 116 400 001 | 117 700 000 | gneg | |
12 | q | 24.23 | 6579 | 6737 | 117 700 001 | 120 300 000 | gpos | 50 |
12 | q | 24.31 | 6737 | 7083 | 120 300 001 | 125 400 000 | gneg | |
12 | q | 24.32 | 7083 | 7255 | 125 400 001 | 128 700 000 | gpos | 50 |
12 | q | 24.33 | 7255 | 7500 | 128 700 001 | 133 275 309 | gneg |
Hivatkozások
- Gilbert F, Kauff N (2000). "Betegséggének és kromoszómák: az emberi genom betegségtérképei. 12. kromoszóma". Genet teszt . 4 (3): 319–33. doi : 10.1089/10906570050501588 . PMID 11142767 .
- Montgomery KT, Lee E, Miller A, Lau S, Shim C, Decker J, Chiu D, Emerling S, Sekhon M, Kim R, Lenz J, Han J, Ioshikhes I, Renault B, Marondel I, Yoon SJ, Song K , Murty VV, Scherer S, Yonescu R, Kirsch IR, Ried T, McPherson J, Gibbs R, Kucherlapati R (2001). "Nagy felbontású térkép az emberi kromoszómáról 12" . Természet . 409 (6822): 945–6. Bibcode : 2001Natur.409..945M . doi : 10.1038/35057174 . PMID 11237017 .
Külső linkek
- Nemzeti Egészségügyi Intézetek. "12 -es kromoszóma" . Genetika otthoni referencia . Archiválva az eredetiből 2007-06-12 . Letöltve: 2017-05-06 .
- "12 -es kromoszóma" . Human Genome Project Information Archívum 1990–2003 . Letöltve: 2017-05-06 .